新算法设计出高效合成酶
来源:科技日报
以色列魏茨曼科学研究院科学家在新一期《自然》杂志发表文章称:他们利用基于酶工作原理的计算机新算法设计出高效人工合成酶。这种新型酶不仅能催化天然蛋白质无法完成的化学反应,其效率更达到人工智能(AI)设计酶的100倍,标志着“按需定制”高效酶的新阶段即将来临。
传统计算机算法辅助设计的酶往往效率低下,需要耗费大量时间进行实验室优化。为突破这一瓶颈,研究团队独辟蹊径,选择“肯普消除”(一种涉及从特定底物碳原子上移除质子的非天然化学反应)作为验证案例。
团队收集天然酶数据作为基础素材,通过计算将蛋白质序列分解成片段。这些片段经过重新组合后,由算法根据原子行为模型筛选出最理想的化学“骨架”。令人惊讶的是,算法推翻了原本认为酶的活性位点需要环状氨基酸的传统认知,计算显示非环状结构反而更高效,这一发现使催化效率获得显著提升。
最终诞生的合成酶与天然酶相比,虽然氨基酸序列差异超过140处,却展现出相当高的催化效率。
研究团队坦言,目前合成的蛋白质结构仍比天然酶简单。以光合作用关键酶rubisco为例,天然酶能通过复杂变化催化多步反应,而这正是团队下一步重点攻关方向。
过去十年,AI蛋白质设计大行其道,但其工作机制主要模仿现有酶。相比之下,新算法的工作机制是基于物理原理来构建酶。研究团队表示,AI在处理某些蛋白质设计时确实无可替代,但对于复杂催化反应仍力不从心。未来需要将两种方法优势互补,才能设计出更完美的酶。
郑重声明:用户在财富号/股吧/博客等社区发表的所有信息(包括但不限于文字、视频、音频、数据及图表)仅代表个人观点,与本网站立场无关,不对您构成任何投资建议,据此操作风险自担。请勿相信代客理财、免费荐股和炒股培训等宣传内容,远离非法证券活动。请勿添加发言用户的手机号码、公众号、微博、微信及QQ等信息,谨防上当受骗!
评论该主题
帖子不见了!怎么办?作者:您目前是匿名发表 登录 | 5秒注册 作者:,欢迎留言 退出发表新主题
郑重声明:用户在社区发表的所有资料、言论等仅代表个人观点,与本网站立场无关,不对您构成任何投资建议。用户应基于自己的独立判断,自行决定证券投资并承担相应风险。《东方财富社区管理规定》